Nhiệm vụ của Bộ môn là giảng dạy các kiến thức cơ bản về Nội Tiết cho sinh viên và đào tạo chuyên sâu, cập nhật kiến thức chuyên ngành Nội Tiết cho các học viên Sau đại học và các bác sĩ đang có hoạt động khám chữa bệnh Nội Tiết ở khu vực phía nam.
Hiện nay, Bộ môn đang thực hiện công tác đào tạo cho các đối tượng: sinh viên y đa khoa (năm 3 và năm 4), sinh viên y học dự phòng, học viên chương trình Bác sĩ Nội trú, Chuyên khoa 1, Chuyên khoa 2, Cao học. Bộ môn phối hợp với các cơ sở thực tập tại các bệnh viện: BV. Chợ Rẫy, BV. Nguyễn Tri Phương và BV. Đại học Y Dược.
Bộ môn thường xuyên có các hoạt động đào tạo y khoa liên tục để cập nhật kiến thức chuyên ngành. Bộ môn đã phối hợp tổ chức nhiều đợt đào tạo y khoa liên tục tại TP. Hồ Chí Minh và tại các tỉnh lân cận như Đồng Nai, Bình Dương, Tây Ninh, Cần Thơ, Kiên Giang, An Giang.