Chương trình đào tạo đại học cho sinh viên năm thứ 3 và tương đương gồm 30 giờ lý thuyết và 2 tuần thực hành, xoay vòng trong suốt năm học. Sau này, bộ môn cùng Nhà trường xây dựng chương trình đổi mới đào tạo bác sĩ y khoa theo hệ thống tín chỉ, nội dung về hình ảnh học y khoa được lồng ghép vào từng module rải trong các năm của chương trình đại học y đa khoa, bắt đầu áp dụng từ niên khóa 2016-2022.
Chương trình đào tạo sau đại học
* Ngắn hạn: hiện nay mỗi năm bộ môn mở các lớp định kỳ:
- Lớp bồi đưỡng chuyên khoa Siêu âm tổng quát thực hành (6 tháng x 2 khóa/năm)
- Lớp bồi đưỡng chuyên khoa X quang và chụp cắt lớp vi tính (6 tháng x 2 khóa/năm)
- Các chứng chỉ đào tạo liên tuc 3-4 đợt (kết hợp với Hội chẩn đoán hình ảnh TPHCM).
- Các chứng chỉ đào tạo ngắn theo kỹ thuật, theo hình ảnh học theo hệ cơ quan
- Các Lớp và chứng chỉ về Điện quang can thiệp
* Dài hạn
- Chuyên khoa 1 (thời gian 2 năm) khóa đầu năm 1986, sau đó liên tục hàng năm từ 1998.
- Chuyên khoa 2 (thời gian 2 năm) khóa đầu năm 1988, sau đó liên tục hàng năm từ 2004.
- Nội trú từ năm (thời gian 3 năm) từ năm 2002.
- Cao học (thời gian 2 năm) từ năm 2007.
Các cơ sở thực hành ngày càng mở rộng theo cả 2 hướng đa khoa và chuyên ngành:
- Trung tâm huấn luyện kỹ năng của Đại học Y Dược TPHCM,
- BV Đại học Y dược TPHCM cơ sở 1, 2 và 3,
- BV Chợ Rẫy,
- BV Nhân Dân Gia Định,
- BV Trưng Vương,
- BV Nguyễn Tri Phương,
- BV Bình Dân
- BV Nhi Đồng 1,
- BV Ung bướu,
- BV Phụ Sản Từ Dũ,
- BV Quận 2,
- BV Thống Nhất